非小細胞肺癌明確病理類型后，要進行TNM分期。部分局限晚期3期之前可行手術治療。 晚期非小細胞肺癌首先進行基因檢測。如查EGFR、KRAS、ALK、ROS1、C―met、HER2、RET、BRAF.基因檢測陽性給予針對性的分子靶向藥物治療。 
1.EGFR突變（19、21突變）：鹽酸?？颂婺崞?、吉非替尼片、鹽酸厄洛替尼片。
第二代EGFR-TKI （野生型及突變型）（18突變）：阿法替尼片。 
第三代EGFR 和T790M耐藥突變:AZD9291（奧希替尼片）對野生型沒有作用。 
Rociletinib(T790M突變）.Osimertinib.
AZD3759對腦實質和腦膜滲透強。
EGFR/HER2基因突變及KRAS野生型。 
盧瑟替尼。

EGFR突變后耐藥的研究：擴增，旁路激活。54％為T790M,34%為T790M+拷貝（c―met）,7%出現單核苷酸變異。

2.ALK基因突變：
c―MET、ALK、ROS1:克唑替尼。的。
第一代ALK:克唑替尼片
第二代ALK:色瑞替尼片
(LDK378)
、AP26113（二個耐藥靶點）、艾樂替尼（三個耐藥靶點）。
第三代ALK:Alectinib，勞拉替尼(9個耐藥靶點）。
ALK/ROS1耐藥可選lorlalinib. 
PF-06463922.

3.EGFR、ALK之外的靶向治療.
Ret融合基因：凡德他尼、Cabozantinib.
C-met擴增導致EGFR抑制劑耐藥：克唑替尼片、Cabozantinib.
ROS1:克唑替尼片、色瑞替尼片、Alectinib、勞拉替尼片。
4.多靶點新藥：索拉非尼片。
5.ERBB2:曲妥珠單抗。

6.免疫治療：PD-1（Vivdumab）/PD-L1抗體藥物。

7.貝伐珠單抗聯合鉑類治療非鱗非小細胞肺癌。

8.HER1/EGFR、HER2、HER4:達克替尼片。

9.BRAF突變：達拉菲尼。

10.多靶點：卡搏替尼（對VEGFR,met,EGFR,KRSA）

11.WEGFR:阿帕替尼片。

12.PIK3CA:如GDC―0941(二期）。

13.NF1:依維莫司。